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    <title>genetics</title>
    <link>https://popups.lib.uliege.be/2984-0317/index.php?id=2401</link>
    <description>Entrées d’index</description>
    <language>fr</language>
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      <title>Using microsatellites to study the conservation of Black Grouse</title>
      <link>https://popups.lib.uliege.be/2984-0317/index.php?id=2409</link>
      <description>We outline the use of microsatellite markers to study the conservation biology and genetics of black grouse (Tetrao tetrix) and other grouse species. Microsatellites are useful in conservation genetics because they allow the detection of fine scale genetic structure, migration and possible negative effects of inbreeding in local populations while requiring minute samples of target DNA. Thus non-invasive techniques such as using shed feathers or faecal samples provide enough DNA for PCR-based genotyping. We have developed microsatellite libraries for both black grouse (Tetrao tetrix) and capercaillie (Tetrao urogallus). These markers contain a high number of alleles and allow us to address the questions outlined above. In this paper we show that the markers are variable, and allow genotypic assignment of black grouse to leks separated by only 5.5 km. Wir zeigen die Möglichkeiten von genetischen Markern für den Naturschutz am Beispiel des Birkhuhns (Tetrao tetrix) auf. Mikrosatelliten Marker sind für den Artenschutz besonders geeignet. Nur geringe Mengen an DNA sind notwendig um Informationen über die genetische Struktur, den Austausch zwischen Populationen und mögliche negative Effekte von Inzucht in kleinen Populationen ermöglichen. Mittels PCR kann selbst DNA von Mauserfedern oder Kotproben für eine Genotypisierung verwendet werden. Wir haben für das Birkhuhn hochpolymorphe Mikrosatelliten entwickelt, die uns ermöglichen die ausgeführten Fragen zu beantworten. Wir zeigen, dass mit diesen hochvariablen Markern eine genotypische Zuordung von Birkhähnen zu Balzplätzen möglich ist, die nur 5.5 km von einander entfernt liegen. Les microsatellites - marqueurs en tandem d'ADN - se révèlent du plus haut intérêt pour l'étude de la génétique et donc de la conservation des Tétras lyres et autres tétraonidés dont les populations d'Europe centrale et occidentale sont de plus en plus isolées et fragilisées. Au départ d'échantillons minimes de séquences cibles d'ADN, il est en effet possible de détecter des structures génétiques à très fine échelle, d'identifier des marqueurs populationnels, de mettre en évidence des déplacements et mouvements migratoires, de mettre au jour d'éventuels effets négatifs de l'endogamie, d'évaluer la diversité et donc le pouvoir d'adaptabilité des petites populations insularisées en danger d'extinction. Il est de toute première importance pour les conservationnistes que ces perspectives reposent sur des techniques non invasives respectant l'intégrité des oiseaux ; des plumes ou des fèces récoltées sur le terrain fournissent en effet suffisamment d'ADN pour réaliser des analyses fines des génotypes. Au départ d'un important échantillon finlandais, les auteurs ont d'abord constitué pour les deux espèces de tétras européens - Tétras lyre et Grand Tétras - une bibliothèque de marqueurs microsatellites de référence. Ils ont ensuite récolté des plumes sur deux arènes de parade en Écosse. Les marqueurs considérés contiennent un nombre important d'allèles dont on peut déterminer la diversité. Celle-ci se révèle importante pour le vaste échantillon finlandais. Pour l'échantillon écossais, 19 coqs sur 20 ont pu être identifiés génétiquement et être assignés sur cette base à l'une ou l'autre de deux arènes distantes seulement de 5,5 km. La technique se révèle donc pleine de promesse pour fournir l'information nécessaire à une politique de conservation.  </description>
      <pubDate>Mon, 25 Mar 2024 10:50:28 +0100</pubDate>
      <lastBuildDate>Mon, 25 Mar 2024 10:50:39 +0100</lastBuildDate>
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      <title>Sense and nonsense of genetic studies on endangered species</title>
      <link>https://popups.lib.uliege.be/2984-0317/index.php?id=2394</link>
      <description>Genetic diversity represents biodiversity at the population level and thus it is the basis for stability and adaptability of populations. Regarding endangered species, this factor, naturally, bears particular importance. Anthropogenic influences on the biocoenoses often result in uncontrolled changes of genetic structures. To minimise or control, respectively, these uncontrolled influences is an essential task of genetics in view of management efforts for species protection. The development of genetic indicator and monitoring systems as estimators of the ability to adaptation and thus to evolutionary progress seems to be an indispensable prerequesite of any future conservation efforts. These systems will have to function as analytical and controlling tools in the scope of species protection. They are to facilitate the survey and supervision of genetic structures as a mirror image of long-term adaptability and thus survivability of endangered populations, hence enhancing the prospects for success of various management measures. To identify appropriate marker systems, it requires some preconditions : first, we need biochemical or molecular traits. It would be an advantage if these traits can be observed even in non-invasive ways such as from e.g. hair or feathers. Moreover, a formal genetic analysis of complete families is an indispensable precondition to identify these traits as genetic markers. When the mode of inheritance has been made clear by genetic analysis, we should combine a set of markers beeing inherited biparenal as well as monoparental, allowing to study particular problems of species conservation. In addition, it would be helpful that several groups dealing with one and the same species should apply identical marker systems to make their results comparable. Genetische Diversität repräsentiert die Biodiversität auf der Ebene der Population und bildet damit die Grundlage der Stabilität und Anpassungsfähigkeit von Populationen. Im Hinblick auf gefährdete Arten hat diese Tatsache naturgemäss eine besondere Bedeutung. Anthropogene Einflüsse auf Biozönosen bewirken oftmals unkontrollierte Veränderungen genetischer Strukturen. Es ist eine wichtige Aufgabe von Managementmassnahmen im Rahmen des Artenschutzes, diese Veränderungen zu minimieren bzw. zumindest kontrolliert zu gestalten. Die Entwicklung von genetischen Inikator- und Monitoringsystemen zur Einschätzung der Fähigkeit zur Anpassung und damit zu evolotiver Fortentwicklung ist somit eine unerlässliche Voraussetzung aller künftiger Schutzmassnahmen. Derartigen Systemen wird in Zukunft eine grosse Bedeutung als Analyse- und Kontrollelemente im Artenschutz zukommen. Ihre wesentliche Autgabe wird darin bestehen, genetische Strukturen als Spiegelbild langfristiger Anpassungsfägkeit und damit Überlebensfähigkeit gefährdeter Populationen zu erforschen und zu überwachen und auf diese Weise eine Möglichkeit zur pro- und retrospektiven Erfolgsbeurteilung von Artenschutzmussnahmen zu schaffen. Die Identifikation geeigneter Markersysteme hat verschiedene Voraussetzungen : zunächst bedarf es biochemischer oder molekularer Merkmale. Es ist von Vorteil, wenn diese Merkmale mit nicht-invasiven Methoden beobachtbar sind, also etwa durch Verwendung von Haaren oder Fedem. Darüberhinaus ist eine formale genetische Analyse vollständiger Familien eine unabdingabre Voraussetzung, um solche Merkmale als genetische marker zu identifizieren. Wenn der Vererbungsmodus durch genetische Analyse geklärt ist, sollten Marker so kombiniert werden, dass mittels bi- oder monoparental vererbter Marker auch spezifische Fragestellungen unstersucht werden können. Schliesslich ist es von grossem Vorteil, wenn verscheidene Arbeitsgruppen, welche an ein und derselben Art arbeiten, auch auf ein identisches Set genetischer Marker zurückgreifen, um ihre Ergebnisse vergleichbar zu halten. La diversité génétique détermine la diversité biologique au niveau populationnel et est dès lors le fondement de la stabilité et de l'adaptabilité des populations. S'agissant des espèces menacées, ce facteur est évidemment de première importance. Les influences anthropiques sur les biocénoses conduisent souvent à des changements dramatiques des structures génétiques. Étudier ces influences incontrôlées et les minimiser est une tâche essentielle des généticiens dans la perspective d'une gestion des efforts de conservation des espèces. La mise au point de systèmes d'indicateurs et de surveillance génétiques en tant qu'outils d'évaluation des aptitudes adaptatives et donc, des processus évolutionnaires en cours, s'impose comme un pré requis de tout effort futur en matière de conservation. Ces systèmes pourront faciliter l'analyse en routine et le contrôle des structures génétiques - véritables images en miroir de l'adaptabilité des populations - et permettront de mieux cibler les mesures de gestion les plus appropriées. Identifier des systèmes appropriés de marqueurs suppose deux conditions. En premier lieu, on a besoin de traits biochimiques ou moléculaires. Il serait intéressant que ces traits puissent être observés et identifiés de manière non invasive, par exemple à partir de cheveux, poils, ou plumes. Ensuite, il est indispensable de réaliser des études génétiques formelles de familles complètes, si on désire être à même d'identifier ces traits comme marqueurs génétiques. Lorsque le processus de transmission de ces traits aura été éclairci par une telle analyse génétique, il conviendra d'utiliser un jeu de marqueurs hérités tant par voie biparentale que par voie uniparentale, permettant ainsi d'étudier des problèmes particuliers de conservation des espèces. De plus, il conviendrait que les équipes travaillant sur une seule et même espèce utilisent les mêmes jeux de marqueurs, de façon que leurs résultats soient comparables. </description>
      <pubDate>Mon, 25 Mar 2024 09:47:17 +0100</pubDate>
      <lastBuildDate>Mon, 25 Mar 2024 09:47:30 +0100</lastBuildDate>
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